Nesta Segunda Temporada, estranhos acontecimentos acompanham os Tennysons em suas novas férias de verão. Ben terá alguns problemas com seu Omnitrix, mas dois novos heróis alienígenas: Raio de canhão e Vinha Selvagem irão surgir e junto com sua prima Gwen e seu Avô Max, eles lutarão contra raças alienígenas destruidoras de mundos.